Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms