Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms