Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms