Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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