Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM46CQ5VWP2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms