Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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