Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms