Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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