Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms