Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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