Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms