Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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VPS72Q15906 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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VPS72Q15906 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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VPS72Q15906 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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VPS72Q15906 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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VPS72Q15906 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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VPS72Q15906 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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VPS72Q15906 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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VPS72Q15906 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms