Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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