Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIP10Q15642 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIP10Q15642 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIP10Q15642 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TRIP10Q15642 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms