Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB35Q15286 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms