Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MLC1Q15049 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms