Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TRAM2Q15035 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TRAM2Q15035 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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TRAM2Q15035 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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TRAM2Q15035 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TRAM2Q15035 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TRAM2Q15035 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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