Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms