Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CHD4Q14839 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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