Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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