Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA9Q13797 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms