Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CDH18Q13634 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CDH18Q13634 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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