Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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C1orf61Q13536 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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C1orf61Q13536 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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C1orf61Q13536 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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C1orf61Q13536 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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