Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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