Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K1Q13233 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K1Q13233 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K1Q13233 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K1Q13233 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K1Q13233 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K1Q13233 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms