Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CALCOCO2Q13137 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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