Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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