Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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