Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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