Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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