Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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