Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms