Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms