Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms