Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms