Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms