Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms