Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms