Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms