Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms