Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms