Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.5 ms