Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms