Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms