Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms