Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2C1P98194 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2C1P98194 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms