Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMF1P82094 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMF1P82094 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMF1P82094 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMF1P82094 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms