Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERVK_113P62684 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms