Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms