Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC3P51654 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC3P51654 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC3P51654 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms